Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PPM1N-204ENST00000401593 548 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 AL355298.1-201ENST00000425391 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 PTPN2P2-201ENST00000433704 1024 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 AC034229.1-201ENST00000506299 943 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 TRIAP1-202ENST00000546954 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 KATNAL2-202ENST00000356157 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NESP48681 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 AC091167.7-201ENST00000622269 518 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 CCNH-203ENST00000504878 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 RPL30-201ENST00000287038 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 SMIM21-201ENST00000382638 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 IGKV2D-26-201ENST00000390268 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 RPL15P3-201ENST00000391491 615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 AP003469.2-201ENST00000524369 430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 AC084033.3-203ENST00000546580 571 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 AC019254.1-202ENST00000558515 645 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NESP48681 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 IGLV4-60-201ENST00000390284 362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 PPP1R7-206ENST00000406106 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 C2orf70-202ENST00000409392 764 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 KRT18P7-201ENST00000557241 1219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 PSMC1P1-201ENST00000478110 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NESP48681 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 POU5F1-205ENST00000512818 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 AL136084.3-201ENST00000605631 439 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NESP48681 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 AL355357.1-203ENST00000402154 639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NESP48681 HLA-U-204ENST00000418981 186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms