Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms