Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC069366.2-201ENST00000583643 430 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 RN7SL328P-201ENST00000484033 300 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 TXNDC9-205ENST00000434323 733 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AL357137.1-201ENST00000604645 203 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.85-201ENST00000610909 260 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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