Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HERC3Q15034 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms