Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms