Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GLOD4-201ENST00000301328 1809 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01254-201ENST00000566225 2908 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PHF21B-212ENST00000629843 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TKTL1-201ENST00000369912 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA4-201ENST00000394295 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CPEB1-215ENST00000617958 2776 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LRRTM4-204ENST00000409884 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM2-209ENST00000494872 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL139348.1-201ENST00000569070 2208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01166-201ENST00000443633 2619 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IGSF5-201ENST00000380588 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms