Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RPS29P62273 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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