Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 WISP1-204ENST00000517423 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NESP48681 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 AC240565.1-201ENST00000624936 1373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 TIPRL-201ENST00000367830 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 IGLV1-44-201ENST00000390297 467 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 ACTG1P10-201ENST00000428275 1082 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 AL118557.1-201ENST00000554408 440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 AP000892.2-201ENST00000613535 324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NESP48681 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 LINC00313-206ENST00000441283 448 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 AC073472.1-201ENST00000441433 803 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NESP48681 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 RN7SKP218-201ENST00000410222 292 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 KCNE1-205ENST00000416357 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 MYADML-202ENST00000490394 797 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 AC023078.3-201ENST00000527463 958 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 AP000911.1-204ENST00000533091 571 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 AC110285.1-201ENST00000572077 665 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NESP48681 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 AL589674.1-201ENST00000454401 222 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 AC011306.1-201ENST00000606639 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NESP48681 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 LEMD2-207ENST00000508327 1306 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NESP48681 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms