Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFNP31947 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFNP31947 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFNP31947 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms