Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HOXD8P13378 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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