Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HBQ1P09105 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms