Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms