Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 NTF3-201ENST00000331010 1028 ntAPPRIS P3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RN7SKP245-201ENST00000364025 320 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CFAP36-205ENST00000407816 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XIRP2A4UGR9 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms