Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms