Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms