Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E2F1Q01094 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E2F1Q01094 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms