Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ACTBP60709 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ACTBP60709 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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