Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
APOBEC1P41238 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms