Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms