Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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