Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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