Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXA13P31271 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms