Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms