Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms