Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTMAP06454 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTMAP06454 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTMAP06454 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTMAP06454 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTMAP06454 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTMAP06454 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms