Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLIP2Q9UDT6 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms