Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms