Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SGCZQ96LD1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SGCZQ96LD1 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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