Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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RNF182Q8N6D2 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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RNF182Q8N6D2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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RNF182Q8N6D2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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RNF182Q8N6D2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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RNF182Q8N6D2 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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RNF182Q8N6D2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RNF182Q8N6D2 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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