Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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RRN3P1Q2M238 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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RRN3P1Q2M238 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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RRN3P1Q2M238 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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