Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CSPP1Q1MSJ5 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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