Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASIC1P78348 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms