Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK8P49336 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CDK8P49336 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CDK8P49336 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CDK8P49336 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CDK8P49336 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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