Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TTLL1-202ENST00000331018 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC073472.1-201ENST00000441433 803 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC091588.2-201ENST00000578741 366 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC012186.3-201ENST00000623850 485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 HNRNPA1P46-201ENST00000411735 937 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 LINC00313-206ENST00000441283 448 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TINF2-210ENST00000559019 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ADGRG5-207ENST00000615867 762 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DAPK1-IT1-201ENST00000431813 702 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC021678.2-201ENST00000521731 887 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 EXOC7-206ENST00000406660 718 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AF274858.2-201ENST00000446370 617 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC015909.2-201ENST00000523083 547 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms