Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MCMBPQ9BTE3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms