Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSPP1Q1MSJ5 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms