Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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