Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL4BQ13620 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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