Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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ACTBP60709 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ACTBP60709 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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