Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK8P49336 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK8P49336 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK8P49336 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK8P49336 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms