Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMPOP42166 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms