Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFNP31947 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFNP31947 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFNP31947 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFNP31947 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFNP31947 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFNP31947 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFNP31947 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SFNP31947 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFNP31947 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFNP31947 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFNP31947 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms