Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 293.1 ms