Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
GZMBP10144 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 TIAM2-201ENST00000275246 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
GZMBP10144 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
GZMBP10144 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
GZMBP10144 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
GZMBP10144 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GZMBP10144 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GZMBP10144 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GZMBP10144 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
GZMBP10144 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
GZMBP10144 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GZMBP10144 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GZMBP10144 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
GZMBP10144 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms