Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C4BP0C0L5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms