Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms