Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC4A4Q9Y6R1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms