Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARFGEF1Q9Y6D6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms