Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms