Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSAG2Q9Y5P2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSAG2Q9Y5P2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms